بررسی ژنومی از قارچها روی پوست ما چارچوبی برای درک این که چگونه این میکروب ها به سلامت پوست و بیماری کمک می کند.
جوامع پیچیده ای از میکروب ها در سطح بدن ما زندگی می کنند. این قارچ ها، باکتری ها و ویروس در مجموع به عنوان میکروبیوم پوست شناخته شده است. یک تیم از موسسه NIH ملی تحقیقات ژنوم انسانی (NHGRI) و موسسه ملی سرطان (NCI) قبلا تکنیک های ژنومی مورد استفاده برای مطالعه باکتری پوست. آنها جوامع مختلف باکتریایی است که بین مردم و توسط سایت پوست متغیر است. در مطالعه جدید خود، این تیم از یک رویکرد ژنومی مشابه برای به دست آوردن درک بهتر از قارچ هایی که روی پوست ما زندگی می کنند.
قارچ شامل قالب، قارچ، و مخمر استفاده می شود که به تخمیر نان و آبجو. این میکروب ها با بسیاری از بیماری های پوستی و شرایط، از جمله پا، اگزما، شوره سر ورزشی و عفونت ناخن انگشت پا همراه است. عفونت های قارچی پوست در سراسر کشور که به طور تخمینی 29 میلیون نفر است. اما قارچ را می توان آهسته و دشوار به رشد در آزمایشگاه، و عفونت های قارچی سخت به شناسایی و درمان.
در ماه مه 22، 2013، دانشمندان نمونه هایی را در سایت های بدن 14 از بزرگسالان سالم 10 جمع آوری کردند. آنها بر روی یک قطعه از DNA که توسط همه قارچها مشترک بودند، متمرکز شده بودند - اسپینر داخلی اینترنال 1 (ITS1) RNA ریبوزومی که می تواند برای طبقه بندی قارچ ها در سطح جنس با بیشتر از 97٪ دقت استفاده شود متمرکز شد.
با تولید بیش از 5 میلیون توالی ITS1 از نمونه، این تیم قادر به شناسایی بیش از نوع قارچی سطح 80 زندگی در پوست انسان است. در مقابل، روش های کشت سنتی می تواند تنها انواع 18 را شناسایی کند. در تمام سایت های پوست یافت شد. نوع غالب در 11 از سایت های 14، از جمله پشت گوش، در سوراخهای بینی، پشت و بر روی سلاح بود.
این تیم متوجه شد که پاشنه هایی که تنوع گسترده باکتریایی را نشان نمی دهند، پیچیده ترین مکان برای قارچ ها بود، و در مورد انواع 80 نشان داده شده است. شبکه های پا، با انواع 60 و ناخن های پا، با 40، دارای بالاترین سطوح مختلف تنوع قارچی بودند. دست ها و اسلحه ها، که دارای تنوع زیادی از باکتری ها بودند، گونه های قارچی نسبتا کمی داشتند. جوامع قارچی در بدن هسته در طول زمان کاملا پایدار بودند، با تغییرات کمی زمانی که تا ماه های مختلف از 3 آزمایش می شد. در مقابل، قارچ ها روی پاها خیلی بیشتر از ماه 3 تغییر کرده اند، شاید منعکس کننده بیشتر در معرض قرار گرفتن در معرض محیط زیست.
جوامع قارچی در بدن انسان پیچیده و خاص سایت هستند، "می گوید: داکتر هیدی کنگ از NCI همکار ارشد. با در اختیار داشتن آگاهی کامل از اکوسیستم های قارچی و باکتری، می توانیم با بیماری های مرتبط با پوست، از جمله عفونت های قارچی، که می تواند مربوط به درمان های سرطانی باشد، بهتر باشد.
داده های مطالعه ما به افراد مبتلا به افراد عادی که پیش از این هرگز پیش از این به ما نرسیده است، به ما می گوید "، می گوید:" دکتر جولی Segre از NHGRI، مدیر ارشد. پایینی است که پای خود را با تنوع قارچی پر می کند، بنابراین اگر شما نمی خواهید مخلوط قارچ پا خود را با قارچ های دیگر، پوشیدن فلیپ فلیپ های خود را در اتاق های قفسه.
